Bệnh viện Đa khoa huyện Kỳ Anh tiền thân là một trạm chuyển thương xây dựng năm 1960 với quy mô nhỏ khoảng 30 giường tại xã Kỳ Hoa- huyện Kỳ Anh. Nhà thương hoạt động với mục đích khám chữa bệnh cho những dân nghèo trên địa bàn khu vực và đảm bảo sự lưu thông bí mật cho chiến trường khi có bộ đội bị thương, cấp cứu và chuyển lên tuyến cao hơn. Nhà thương đi vào hoạt động và chịu sự quản lý trực tiếp của Ủy ban nhân dân huyện Kỳ Anh.
Bệnh viện Đa khoa thị xã Kỳ Anh là bệnh viện công lập Hạng 2 tại Hà Tĩnh. Bệnh viện đảm bảo chuyên môn và hạ tầng để đảm nhận chức năng thăm khám tại địa phương. Cung cấp kip thời và chi tiết các thông tin hướng dẫn chăm sóc sức khỏe cho cộng đồng. Tuy cơ sở vật chất còn thiếu thốn, bệnh viện luôn nỗ lực cải thiện chuyên môn.
Bên cạnh hoạt động thăm khám, bệnh viện còn hỗ trợ các công tác đào tạo, nghiên cứu y học. BVĐK thị xã Kỳ Anh là địa chỉ vàng trong thăm khám và điều trị tại Hà Tĩnh.