Bệnh viện GTVT là bệnh viện đa khoa hạng II với nhiệm vụ khám chữa bệnh và phục hồi sức khỏe cho cán bộ công nhân viên thuộc ngành Giao thông vận tải và các đối tượng khác theo quy định của pháp luật. Ngoài ra, bệnh viện cũng thực hiện chức năng của Chi nhánh Trung tâm bảo vệ sức khỏe lao động và môi trường Giao thông vận tải của khu vực trên các lĩnh vực: Phòng dịch, vệ sinh môi trường, quản lý và xây dựng mạng lưới y tế, kiểm định môi trường lao động, thực hiện các chương trình y tế cho các đơn vị giao thông vận tải khu vực miền Trung – Tây Nguyên và các tổ chức khác khi được yêu cầu. Bệnh viện có liên kết với các ban ngành, đoàn thể như Cục Y tế Giao thông vận tải, Bộ y tế,…
Đội ngũ y bác sĩ, nhân viên y tế của bệnh viện có tay nghề cao, dày dạn kinh nghiệm và thái độ làm việc chuyên nghiệp. Hầu hết các nhân viên y tế đều được trang bị kiến thức chuyên ngành tối đa.