Bệnh viện Nhi tỉnh Thanh Hóa được thành lập ngày 01/6/2001 theo quyết định của Chủ tịch UBND tỉnh Thanh Hóa, chính thức tiếp nhận bệnh nhân từ tháng 9/2007. Hiện nay, bệnh viện có quy mô 750 giường theo kế hoạch và 1.050 giường thực kê với cơ sở vật chất đảm bảo cùng đội ngũ y bác sĩ chất lượng phục vụ cho công tác khám, điều trị bệnh khá đồng bộ.
Nhiều trang thiết bị hiện đại được áp dụng giúp hiệu quả điều trị bệnh cao hơn như: Máy siêu âm màu, máy chụp X-quang tăng sáng, hệ thống nội soi ống mềm cho hệ tiêu hóa…
Với vai trò là bệnh viện vệ tinh Bệnh viện Nhi Thanh Hóa sẽ được Bệnh viện Nhi TW hỗ trợ về chuyên môn kỹ thuật để nâng cao trình độ chuyên môn cho đội ngũ y bác sĩ, từ đó giảm khoảng cách về chất lượng dịch vụ giữa các bệnh viện tuyến trung ương và địa phương.