Với chức năng, nhiệm vụ trọng tâm là chăm sóc sức khỏe cho người lao động các công ty, đơn vị trực thuộc Tập đoàn. Mỗi năm, Bệnh viện Than – Khoáng sản đã tổ chức khám, phân loại sức khỏe cho hàng vạn người lao động. Đồng thời điều trị bệnh nghề nghiệp, các chuyên khoa cho hàng ngàn lượt công nhân, cán bộ trong và ngoài ngành. Đây là một đặc điểm khác biệt trong hệ thống các bệnh viện thuộc các tuyến và các tỉnh thành trong cả nước. Bởi ngành Than – Khoáng sản có số lượng lao động đông, tổng số có thời điểm lên đến gần 14 vạn người. Công tác theo dõi, chăm sóc sức khỏe, triển khai các dự án y tế dự phòng. Đặc biệt là theo dõi, điều trị bệnh nghề nghiệp tại cơ sở là một nhiệm vụ không dễ.
Bệnh viện hiện quản lý hai Trung tâm Y tế khu vực tại Mạo Khê, Vàng Danh. Đồng thời hướng dẫn nghiệp vụ, phối hợp tổ chức hệ thống các phòng y tế của các công ty, đơn vị trực thuộc Tập đoàn trong việc theo dõi, chăm sóc sức khỏe, triển khai y tế dự phòng và điều trị bệnh nghề nghiệp cho người lao động.